Hlavne veľké organizácie niekedy vyžadujú špeciálne riešenie na mieru. Môže ísť napríklad o úpravy odmeňovania podľa kolektívnej zmluvy, zákazkový modul hodnotenia, špecifické portálové dokumenty, zákazkovo riešené zabezpečenie či workflow procesov alebo špecializované výstupné moduly pre integráciu s ďalšími systémami. Zákazkové úpravy sa väčšinou distribuujú a udržujú ako samostatné produkty. Vybrané používateľské úpravy výpočtu (sick day, ďalšia mzda/plat, špeciálne algoritmy pre výpočet životného/penzijného pripoistenia) sú súčasťou štandardu aplikácie Mzdy.
Nový rad všeobecných portálových aplikácií (Rozdeľovanie odmien, Plánovanie a evidencia výkonov, Plánovanie zmien, Hodnotenie) počíta s prípadnými požiadavkami na individuálne úpravy a umožňuje ich zapracovávať rýchlo a efektívne.